Genome Biology·· 5 天前AI 评分60
TraSPIN:用语言模型引导的图学习推断转运蛋白底物特异性
TraSPIN: inferring transporter specificity through language model-guided graph learning
AI 导读
研究提出 TraSPIN,一个几何深度学习框架,同时建模转运蛋白蛋白与小分子底物,用于推断底物特异性。作者称其在基准上优于现有方法,可泛化到未见底物和序列差异较大的转运蛋白,并揭示转运蛋白与底物识别的结构决定因素和序列基序。跨物种推断和对未表征 solute carrier 蛋白的去孤儿化进一步展示了该框架在功能注释上的用途。
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来源:Genome Biology · doi.org