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Cell 发表 SPARCS 平台:近 7000 万细胞图像表型的全基因组 CRISPR 筛选
Cell | 全基因组筛选!近7000万细胞、2.1亿单细胞图像,SPARCS开启复杂表型遗传筛选新路径
AI 导读
德国慕尼黑大学 Veit Hornung 团队与马克斯·普朗克生物化学研究所 Matthias Mann 团队等在 Cell 报道了 SPARCS,将高内涵显微成像、深度学习分类、自动化激光显微切割与 sgRNA 测序整合为一条流程,使复杂细胞图像表型可用于全基因组 CRISPR 筛选。平台在可激光切割的 PPS 膜上培养细胞,用开源工具 py-lmd 生成切割路径,回收效率约 1000 个细胞核/小时、实际收集效率约 80%。
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来源:公众号:生信人 · mp.weixin.qq.com
推荐理由
把高内涵成像、深度学习与激光显微切割串成一条流程,让复杂亚细胞表型也能做全基因组筛选。