SPARCS空间CRISPR筛选平台登上Cell

德国慕尼黑大学Veit Hornung团队与马克斯·普朗克生物化学研究所Matthias Mann团队等在Cell发表SPARCS平台，把高内涵显微成像、深度学习分类、自动化激光显微切割与sgRNA测序整合成一条流程，使复杂细胞图像表型可用于全基因组CRISPR筛选。团队在4000万U2OS细胞和2940万HeLa细胞中开展了全基因组筛选。 平台在可激光切割的PPS膜上培养细胞，用开源工具py-lmd生成切割路径，回收效率约1000个细胞核/小时，实际收集效率约80%。 研究同时指出，目前激光切割效率仍有限，混合细胞测序尚无法实现单细胞图像与基因型一一对应，计算预测结果也需进一步验证。

AI 根据报道生成 · 2 小时前更新

还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。