多物种4D时空转录组数据库4D-atlas发布
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多物种4D时空转录组数据库4D-atlas发布
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AI 综述
4D-atlas研究团队在 Nucleic Acids Research 发布多物种四维时空转录组公开数据库4D-atlas,作者称其为首个专门收录此类图谱的公开资源。 该库收集并标准化了来自六个物种、15个代表性数据集的1629张空间切片,覆盖88个不同时间点(每个数据集含2–41个时间点),共超过2220万个细胞或空间位点,涵盖胚胎发育、组织再生和疾病进展。 除数据收集外,4D-atlas提供七个交互式分析模块,支持在三维空间加时间维度上探索组织形态发生、空间基因模块、通路活性、调控网络、细胞间通讯、发育轨迹和时间表达模式;作者称其用统一分析流程整合离散生物学阶段的三维空间结构与分子信息,以支持跨时间和空间的系统研究。
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最新进展10月23日 16:09
4D-atlas 发布多物种四维时空转录组数据库报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月23日
- Nucleic Acids Research精选4D-atlas 发布多物种四维时空转录组数据库
4D-atlas 是一个面向多物种四维时空转录组的公开数据库,作者称其为首个专门收录此类图谱的公开资源。该库收集并标准化了来自六个物种、15 个代表性数据集的 1629 张空间切片,覆盖 88 个不同时间点,每个数据集含 2–41 个时间点,共超过 2220 万个细胞或空间位点,涵盖胚胎发育、组织再生和疾病进展。除数据收集外,4D-atlas 提供七个交互式分析模块,支持在三维空间加时间维度上探索组织形态发生、空间基因模块、通路活性、调控网络、细胞间通讯、发育轨迹和时间表达模式。作者用统一分析流程整合离散生物学阶段的三维空间结构与分子信息,以支持跨时间和空间的系统研究。
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