WasteFams发布全球污水微生物组蛋白家族数据库

WasteFams作者团队发布数据库WasteFams，系统收录全球污水宏基因组与宏转录组中的蛋白家族。作者称这是首个专门用于系统探索污水微生物组蛋白家族的综合性数据库。 该库整合580个宏基因组、132个宏转录组和1709个参考基因组，过滤后保留504个宏基因组、129个宏转录组和1151个参考基因组，从超过1.05亿条预测蛋白中整理出3887个非冗余蛋白家族，每个家族至少含100个成员。每个家族附带AlphaFold3结构预测、分类学归属和生物群系元数据，并通过深度基因组上下文分析关联移动遗传元件、生物合成基因簇、抗生素抗性基因和CRISPR元件。 数据库通过EnvoFams门户访问，提供高级搜索、序列与结构相似性工具及交互式可视化模块。

AI 根据报道生成 · 2 小时前更新

还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。