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量子化学表面描述符提升未见溶剂溶解度预测

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AI 综述

研究团队构建了一个固定溶剂级 OOD 基准:从 BigSolDB v2.1 的 103,262 条对齐记录中排除 5 种溶剂,使其不参与模型训练、验证、早停、SHAP 排序和特征选择。紧凑的 RDKit 二维基线在随机划分下 IID R2 为 0.954 ± 0.001,但在留出溶剂上 OOD R2 降至 0.541 ± 0.019;加入 Gasteiger 电荷代理和单体级 GFN2-xTB/COSMO σ-moment 表面描述符后,OOD R2 升至 0.756 ± 0.007。 提升幅度因溶剂而异:DMSO、NMP 和环己烷误差下降最大,乙二醇变化不大,乙酸正丙酯略差于静电基线。研究还发现,优化的 1:1 二聚体及小型 1:2/2:1 团簇并未改善该固定 OOD 结果。

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报道时间线

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10月24日
  1. Journal of Chemical Information and Modeling
    量子化学表面描述符提升未见溶剂上的溶解度预测

    研究构建了一个固定溶剂级 OOD 基准,从 BigSolDB v2.1 的 103,262 条对齐记录中排除 5 种溶剂,使其不参与模型训练、验证、早停、SHAP 排序和特征选择。紧凑的 RDKit 二维基线在随机划分下 IID R2 为 0.954 ± 0.001,但在留出溶剂上 OOD R2 降至 0.541 ± 0.019;加入 Gasteiger 电荷代理和单体级 GFN2-xTB/COSMO σ-moment 表面描述符后,OOD R2 升至 0.756 ± 0.007。

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