openDVP开源空间蛋白质组学框架发布

Nature Methods 论文作者发布开源端到端深度视觉蛋白组（DVP）框架 openDVP，用于对细胞邻域进行可扩展、高分辨率的蛋白组分析。该框架整合 MCMICRO、QuPath、napari 与 scverse 的 AnnData、SpatialData 格式以支持多组学整合，并提供两条工作流：一条面向无图像分析经验的快速通道，另一条引入图像预处理、分割和空间分析先进方法的人工智能流程。 作者称已在人类胎盘、早期肺癌和局部复发乳腺癌三项存档组织研究中应用 openDVP，将空间单细胞表型与探索性蛋白组测量整合，并提出细胞邻域深度蛋白组分析作为空间发现蛋白组学的可扩展路径。

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还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。