上海交大团队发布天然转化数据库NTDB
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上海交大团队发布天然转化数据库NTDB
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AI 综述
上海交通大学团队在 Nucleic Acids Research 发布天然转化数据库 NTDB,汇总原核生物天然转化机器与调控基因信息,网址为 https://bioinfo-mml.sjtu.edu.cn/NTDB/。据论文,该库整合文献挖掘并经实验验证的数据,覆盖 118 个天然可转化物种、1072 个转化相关基因和 10 个 DNA 摄取基序。 团队还通过同源搜索,在 12 310 个原核菌株中鉴定出 420 600 个机器基因和 246 164 个调控基因,并附蛋白注释。后续一条 Bluesky 帖文转述了该数据库的发布,称自然转化由专门的机器与调控基因控制,驱动原核生物的进化与适应。
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最新进展10月20日 01:14
NTDB:原核生物自然转化机器与调控基因的 curated 数据库报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月20日
- Bluesky:Cameron Thrash (@jcamthrash.bsky.social)NTDB:原核生物自然转化机器与调控基因的 curated 数据库
NTDB 是一个原核生物自然转化机器与调控基因的 curated 数据库,相关论文发表于 Nucleic Acids Research。自然转化由专门的机器与调控基因控制,驱动原核生物的进化与适应。
10月19日
- Nucleic Acids ResearchNTDB 数据库发布,收录原核生物天然转化机器与调控基因
上海交通大学团队发布天然转化数据库 NTDB(https://bioinfo-mml.sjtu.edu.cn/NTDB/),整合文献挖掘得到的 118 个天然可转化物种、1072 个转化相关基因和 10 个 DNA 摄取基序的实验验证数据。
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还没有足够的连续观测数据,暂不绘制趋势。