eCLIP绘制SARS-CoV-2 RNA与三种病毒蛋白互作图谱
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eCLIP绘制SARS-CoV-2 RNA与三种病毒蛋白互作图谱
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研究团队在《Nature Communications》发表研究，用增强型交联免疫沉淀（eCLIP）在活病毒感染早期和晚期，绘制了SARS-CoV-2 NSP8、NSP12和N蛋白与全长病毒RNA的直接结合位点。 结果显示，NSP8和NSP12结合正负义RNA的5′和3′端，与二者在复制、转录和翻译中的作用一致；NSP12还在NSP3保守Y1结构域内有结合位点，可调节RNA和蛋白丰度。N蛋白结合5′ UTR，提示其在感染早期参与翻译调控，并与移码元件结合、调节核糖体移码。 作者称，这些位点勾勒出病毒基因组上的调控区域，可作为抗病毒干预的潜在靶点。
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最新进展10月30日 08:00
eCLIP 绘制 SARS-CoV-2 RNA 与 NSP8、NSP12、N 的全基因组互作图谱报道时间线
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10月30日
- Nature CommunicationseCLIP 绘制 SARS-CoV-2 RNA 与 NSP8、NSP12、N 的全基因组互作图谱
研究团队用增强型交联免疫沉淀（eCLIP）在活病毒感染早期和晚期，绘制了 SARS-CoV-2 NSP8、NSP12 和 N 蛋白与全长病毒 RNA 的直接结合位点。NSP8 和 NSP12 结合正负义 RNA 的 5′ 和 3′ 端，与其在复制、转录和翻译中的作用一致；NSP12 还在 NSP3 保守 Y1 结构域内存在结合位点，可调节 RNA 和蛋白丰度。N 蛋白结合 5′ UTR，提示其在感染早期参与翻译调控，并与移码元件结合、调节核糖体移码。作者认为这些位点勾勒出病毒基因组上的调控区域，可作为抗病毒干预的潜在靶点。
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