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scTraitReg单细胞多组学eRegulon数据库发布

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AI 综述

scTraitReg 作者团队发布单细胞分辨率数据库 scTraitReg,收录性状相关转录因子 eRegulon,即转录因子及其靶基因与关联顺式调控区。该库整合 655 套经整理的 GWAS 汇总统计(覆盖 122 个 MeSH 疾病词条)与 111 套在同一细胞中同时测定 RNA 和染色质可及性的人单细胞多组学数据。 据作者称,按细胞类型特异性、遗传相关性和性状相关调控子评分三项标准筛选后,67 666 条记录被纳入为候选性状相关 eRegulon 记录。 作者称该库可检索、可复用,用于连接遗传关联与细胞类型特异性调控程序,并已在 https://www.sctraitreg.bio/ 免费开放。

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报道时间线

沿着报道,了解事件的不同侧面。

10月22日
  1. Nucleic Acids Research
    scTraitReg 数据库发布:单细胞多组学解析性状相关转录因子 eRegulon

    scTraitReg 是一个在单细胞分辨率上收录性状相关转录因子 eRegulon(转录因子及其靶基因与关联顺式调控区)的数据库,整合了 655 套经整理的 GWAS 汇总统计(覆盖 122 个 MeSH 疾病词条)与 111 套在同一细胞中同时测定 RNA 和染色质可及性的人单细胞多组学数据。资源覆盖 34 种组织、252 种细胞类型、2 081 538 个细胞和 2208 对 GWAS 与单细胞分析配对,共得到 886 个调控因子的 2 840 939 条转录因子与细胞类型记录。

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