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scEM-seq:液滴单细胞酶法甲基化测序

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AI 综述

研究团队提出 scEM-seq,一种基于液滴的单细胞酶法甲基化组测序方法:把条形码连接整合进单次乳化步骤,破乳后再做胞嘧啶到尿嘧啶的转化,以减少 DNA 损失,单次实验可分析数万个单细胞的甲基化组。 与其他液滴微流控方法相比,作者称 scEM-seq 的 CpG 覆盖度有中等幅度提升,读段利用也更均衡。在外周血单个核细胞上,它准确区分了主要免疫谱系;在前列腺癌组织中,它揭示了多种恶性细胞状态以及患者特异的表观遗传与拷贝数结构。作者认为该方法可扩展到多种生物学与疾病场景下的表观异质性解析。

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10月24日
  1. Science Advances
    scEM-seq:基于液滴的高通量单细胞酶法DNA甲基化测序

    研究团队提出 scEM-seq,一种基于液滴的单细胞酶法甲基化组测序方法,把条形码连接整合进单次乳化步骤,再在破乳后进行胞嘧啶到尿嘧啶的转化,从而减少DNA损失,单次实验可对数万个单细胞进行甲基化组分析。与其他液滴微流控方法相比,scEM-seq 的 CpG 覆盖度有中等幅度提升,读段利用也更均衡。在外周血单个核细胞上,它能准确区分主要免疫谱系;在前列腺癌组织中,它揭示了多种恶性细胞状态以及患者特异的表观遗传与拷贝数结构。作者认为该方法可扩展到多种生物学与疾病场景下的表观异质性解析。

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