日本鹌鹑近T2T基因组揭示异染色质扩张
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日本鹌鹑近T2T基因组揭示异染色质扩张
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AI 综述
西南大学徐洛浩与扬州大学常国斌团队在 Cell Reports 发表日本鹌鹑近T2T基因组，组装大小 1.33 Gb，显著高于此前报道的鹌鹑基因组和大多数鸟类基因组，重复序列含量明显增加。 扩张主要发生在微染色体和点染色体，与卫星DNA和转座元件积累相关；转座元件插入时间分析显示近400万年内出现明显 LINE 扩增。 结合 CENP-A CUT&Tag 数据，研究鉴定出 458 bp 的保守着丝粒核心重复序列 Cjap458，其与 CENP-A 富集区高度一致；研究还整合组蛋白修饰、DNA甲基化和ATAC数据，比较了鹌鹑与鸡的染色质状态。
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最新进展10月23日 14:30
Cell Rep | 常国斌/徐洛浩联合发布鹌鹑T2T基因组，揭示微染色体异染色质扩张报道时间线
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10月23日
- 公众号：BioArtMEDCell Rep | 常国斌/徐洛浩联合发布鹌鹑T2T基因组，揭示微染色体异染色质扩张
西南大学徐洛浩与扬州大学常国斌团队在 Cell Reports 在线发表近T2T水平的日本鹌鹑基因组，组装大小 1.33 Gb，显著高于此前报道的鹌鹑基因组和大多数鸟类基因组，重复序列含量明显增加。扩张主要发生在微染色体和点染色体，与卫星DNA和转座元件积累相关；转座元件插入时间分析显示近400万年内出现明显 LINE 扩增。结合 CENP-A CUT&Tag 数据，研究鉴定出 458 bp 的保守着丝粒核心重复序列 Cjap458，其与 CENP-A 富集区高度一致。
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