Sup-seq实现全基因组遗传抑制检测
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Sup-seq实现全基因组遗传抑制检测
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研究团队在《Nature Communications》报告了 Sup-seq：一种带随机 DNA 条形码的转座子测序技术，可在全基因组范围检测遗传抑制事件。 在肺炎链球菌的 7 个必需基因上应用该技术，共找到 53 个抑制因子，涉及多种细胞通路；这些抑制因子通过基因失活、过表达或下调等不同机制起作用，具体取决于转座子插入的位置和方向。概念验证实验还鉴定出一个此前未表征的转录调控因子，它控制分子伴侣和核糖体蛋白的表达，并发现一条绕过 acetate kinase 生长需求的机制。 研究团队称，Sup-seq 可适配其他细菌，有助于发现新的抗菌靶点。
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最新进展10月22日 08:00
Sup-seq 实现肺炎链球菌遗传抑制事件的全基因组定位报道时间线
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10月22日
- Nature CommunicationsSup-seq 实现肺炎链球菌遗传抑制事件的全基因组定位
研究团队提出 Sup-seq，一种带随机 DNA 条形码的转座子测序技术，可在全基因组范围检测遗传抑制事件。在 Streptococcus pneumoniae 的 7 个必需基因上应用 Sup-seq，共找到 53 个抑制因子，涉及多种细胞通路；这些抑制因子通过基因失活、过表达或下调等不同机制起作用，具体取决于转座子插入的位置和方向。概念验证实验鉴定出一个此前未表征的转录调控因子，它控制分子伴侣和核糖体蛋白的表达，并发现一条绕过 acetate kinase 生长需求的机制。
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