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城市化驱动熊蜂跨城市跨物种平行基因组分化

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AI 综述

一项发表于 Genome Biology 的研究对中欧 9 组独立城乡配对中 3 种广泛分布熊蜂的 524 个个体做全基因组分析,结论是城市化可在不同城市和不同物种间反复产生可预测的平行基因组响应。 遗传多样性对城市化的响应因物种而异:两种熊蜂未检出城乡差异,一种在城区多样性降低。尽管各物种群体结构弱、基因流高,研究仍检测到与城市环境相关的可重复基因组分化,同一物种在不同独立城市中相同位点出现平行等位基因频率变化,选择性清除扫描也发现城区群体中重复的正选择信号。 城市相关分化高度多基因,主要位于可能具调控作用的非编码区;具体基因多具物种特异性,但功能富集在生理应激、神经认知与行为、代谢和免疫通路上高度趋同。

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报道时间线

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10月26日
  1. Genome Biology
    城市化驱动不同城市与熊蜂物种间的平行基因组分化

    对中欧 9 组独立城乡配对中 3 种广泛分布熊蜂的 524 个个体的全基因组数据分析显示,城市化可在不同城市和物种间反复产生可预测的平行基因组响应。遗传多样性对城市化的响应因物种而异:两种熊蜂未检出城乡差异,一种在城区多样性降低。尽管各物种群体结构弱、基因流高,仍检测到与城市环境相关的可重复基因组分化,同一物种在不同独立城市中相同位点出现平行等位基因频率变化,选择性清除扫描也发现城区群体中重复的正选择信号。城市相关分化高度多基因,主要位于可能具调控作用的非编码区;具体基因多具物种特异性,但功能富集在生理应激、神经认知与行为、代谢和免疫通路上高度趋同。

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