XChrom跨细胞染色质可及性预测模型发表

中国科学院上海营养与健康研究所人工智能与数字健康部团队在 Advanced Science 在线发表深度学习框架 XChrom，将基因组序列与单细胞 RNA 测序反映的细胞状态结合，用于预测不同细胞中的染色质可及性并推断转录因子活性。 团队利用来自人类和小鼠的五组公开配对数据评估：跨基因组区域预测中，XChrom 与序列模型 scBasset 表现相当；跨细胞预测中，在多项指标上优于 Seurat、MultiVI 等模型，并可同时预测训练中未见过的区域和细胞。所用数据均来自公共数据集，XChrom 已作为开源 Python 软件包发布于 GitHub。

AI 根据报道生成 · 2 小时前更新

还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。