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上海营养与健康所团队在 Advanced Science 发表跨细胞染色质可及性预测模型 XChrom
工程实验室人工智能与数字健康部开发整合基因组序列和细胞身份信息的跨细胞染色质可及性预测模型XChrom
AI 导读
中国科学院上海营养与健康研究所人工智能与数字健康部团队在 Advanced Science 在线发表深度学习框架 XChrom，将基因组序列信息与单细胞 RNA 测序反映的细胞状态结合，用于预测不同细胞中的染色质可及性并推断转录因子活性。研究利用人类和小鼠的五组公开配对数据评估：跨基因组区域预测中与序列模型 scBasset 表现相当，跨细胞预测中在多项指标上优于 Seurat、MultiVI 等模型，并可同时预测训练中未见过的区域和细胞。
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