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Omni-ARMD耐药基因组与临床知识库发布

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AI 综述

Omni-ARMD研究团队在《Nucleic Acids Research》发布开放获取知识库Omni-ARMD，整合多来源基因组与临床数据，系统推断抗菌药物耐药的基因型—表型关系。团队称，该库用置信度加权的对数优势比富集框架，在物种—抗菌药物层面量化关联。当前版本收录来自100多万名患者的逾1200万条去标识微生物学记录，整理出逾783万条标准化药敏记录，并整合逾36万条基因—表型关联，覆盖38个物种、52种抗菌药物和375个耐药基因。该库将逾516万条临床记录与基因组证据关联，匹配率65.86%，物种—抗菌药物组合覆盖率为2.61%。知识库可通过www.omniarmd.cn免费获取。

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最新进展10月27日 11:46

Omni-ARMD 知识库发布，整合耐药基因组与临床药敏数据

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10月27日

11:46
Nucleic Acids Research
Omni-ARMD 知识库发布，整合耐药基因组与临床药敏数据
Omni-ARMD 是一个开放获取的耐药知识库，整合多来源基因组与临床数据，系统推断抗菌药物耐药的基因型—表型关系。研究团队用置信度加权的对数优势比富集框架，在物种—抗菌药物层面量化基因型与表型的关联，并汇总为跨域证据表示。当前版本收录来自 100 多万名患者的逾 1200 万条去标识微生物学记录，整理出超过 783 万条标准化药敏（AST）记录，并整合超过 36 万条基因—表型关联，覆盖 38 个物种、52 种抗菌药物和 375 个耐药基因。该库将超过 516 万条临床记录与基因组证据关联，匹配率 65.86%，物种—抗菌药物组合覆盖率为 2.61%。

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