BacMap 3.0 细菌基因组知识库发布
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BacMap 3.0 细菌基因组知识库发布
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AI 综述
BacMap 3.0 已发布,将 23 524 个细菌与古菌物种、32 866 个基因组、超过 1 亿个基因、1756 条初级代谢通路和 45 284 种代谢物整合到同一交互平台,网址为 https://bacmap.ca,报道称其可免费访问。 该版本以物种为中心构建 BacCard,把交互式基因组图谱与分类、生理、形态、代谢、蛋白结构、通路、代谢物、表型、生态和系统发育注释合并,以缓解基因组注释、分类、代谢通路与表型信息分散在多个专业数据库的问题。平台支持按分类和表型浏览、化学结构检索、基因组可视化,以及基因、基因组、16S RNA 和蛋白 BLAST 搜索。 据发布方介绍,早期版本主要用于基因组可视化,BacMap 3.0 将物种覆盖范围扩大 13 倍以上,并转型为面向基因组到功能研究的整合型细菌知识库。
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最新进展10月29日 15:57
BacMap 3.0 发布:整合 32 866 个细菌与古菌基因组的注释知识库报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月29日
- Nucleic Acids ResearchBacMap 3.0 发布:整合 32 866 个细菌与古菌基因组的注释知识库
BacMap 3.0 发布,将 23 524 个细菌与古菌物种、32 866 个基因组、超过 1 亿个基因、1756 条初级代谢通路和 45 284 种代谢物整合到同一交互平台。该版本以物种为中心构建 BacCard,把交互式基因组图谱与分类、生理、形态、代谢、蛋白结构、通路、代谢物、表型、生态和系统发育注释合并在一起,缓解基因组注释、分类、代谢通路与表型信息分散在多个专业数据库的问题。平台支持按分类和表型浏览、化学结构检索、基因组可视化,以及基因、基因组、16S RNA 和蛋白 BLAST 搜索。
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