结构引导挖掘TadA,开发新型腺嘌呤碱基编辑器
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结构引导挖掘TadA,开发新型腺嘌呤碱基编辑器
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AI 综述
中山大学松阳洲团队、南方医科大学珠江医院陈柏洪团队与微光基因胡洋团队在 Molecular Therapy 发表研究,建立基于蛋白质三维结构的 TadA 脱氨酶挖掘与工程化改造策略,获得 eMaTadA、eErTadA 等新型骨架,并据此构建 eMa-ABE 和 eEr-ABE 两种腺嘌呤碱基编辑器。 研究以 ecTadA-8e 结构为模板,结合 AlphaFold2 结构预测、Foldseek 结构搜索和 TM-align 比对,从大规模结构数据库中筛出 157 个候选蛋白,并选取其中 8 个骨架做实验验证。报道称,eMa-ABE 在部分靶位点实现接近 80% 的编辑效率,并在小鼠肝脏中实现约 50% 的目标突变等位基因修复;研究还在人源造血干细胞和遗传病小鼠模型中验证了应用潜力。
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最新进展11月7日 14:30
松阳洲/陈柏洪/胡洋团队以结构引导挖掘 TadA 脱氨酶,开发新型腺嘌呤碱基编辑器报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
11月7日
- 公众号:BioArtMED松阳洲/陈柏洪/胡洋团队以结构引导挖掘 TadA 脱氨酶,开发新型腺嘌呤碱基编辑器
中山大学松阳洲、南方医科大学珠江医院陈柏洪与微光基因胡洋团队在 Molecular Therapy 发表研究,建立基于蛋白质三维结构的 TadA 脱氨酶挖掘与工程化改造策略,获得 eMaTadA、eErTadA 等新型骨架并构建 eMa-ABE 和 eEr-ABE。研究以 ecTadA-8e 结构为模板,结合 AlphaFold2 结构预测、Foldseek 结构搜索和 TM-align 比对,从大规模结构数据库中筛出 157 个候选蛋白,选取 8 个骨架做实验验证。
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