高彩霞团队建立双子叶植物高效引导编辑系统SmartPE

中国科学院遗传与发育生物学研究所高彩霞团队在 Nature Plants 发表论文，建立 SmartPE 引导编辑系统，在双子叶植物中实现较普适的高效编辑。该系统在双 pegRNA 的逆转录模板中引入互补错配，结合顺式调控元件 START（使编辑器转录水平提高 2.1 倍）与工程化逆转录酶；在拟南芥四个内源靶点上平均编辑活性提高 6 倍以上，最高约 10%。 在原生质体实验中，番茄 9 个靶点中有 6 个编辑效率超过 10%，大豆 11 个靶点中有 9 个超过 5%，油菜 5 个靶点最高效率达到并超过 10% 左右，而常规引导编辑在部分靶点上几乎没有活性。研究同时指出，大豆中目前只得到嵌合体，需进一步研究；SmartPE 与单 pegRNA 策略在细胞内的修复通路可能不同，其分子机制仍待阐明。 错配设计规律显示，连续错配或间隔 3 bp 时效率最高可达 20%，间隔 6 bp 以上明显下降，位于编辑窗口两端的错配更有效。

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还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。