机器学习预测CYP450诱导与PXR激活的基准评测
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机器学习预测CYP450诱导与PXR激活的基准评测
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AI 综述
研究团队用覆盖CYP3A4、CYP2B6、CYP1A2三种酶诱导及PXR激活的工业规模数据集,在六种分子表示下基准评测四种机器学习模型,并与基于公开数据训练的模型比较。结果显示,内部数据上最佳模型区分诱导剂与非诱导剂仅达中等水平(MCC 0.35–0.46),且无法预测诱导幅度;几乎没有任何模型或表示显著优于其他方案,研究据此认为限制因素在数据而非方法。 公开数据呈相同规律:大型公开PXR数据集能达到该区间,而规模小、异质性高的公开CYP3A4数据集则失败。研究称,这些模型可用于在适用域内对化合物进行优先级排序。 上述结论来自该研究的基准评测,模型区分能力有限、无法预测诱导幅度均为其报告的结果。
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最新进展10月31日 00:02
用机器学习预测 CYP450 诱导与 PXR 激活:挑战与机会报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月31日
- Journal of Chemical Information and Modeling用机器学习预测 CYP450 诱导与 PXR 激活:挑战与机会
研究利用覆盖 CYP3A4、CYP2B6、CYP1A2 三种酶诱导及 PXR 激活的工业规模数据集,在六种分子表示下基准评测了四种机器学习模型,并与基于公开数据训练的模型比较。内部数据上最佳模型对诱导剂与非诱导剂的区分仅为中等水平(MCC 0.35–0.46),且无法预测诱导幅度;几乎没有任何模型或表示显著优于其他方案,说明限制因素在数据而非方法。公开数据呈相同规律:大型公开 PXR 数据集能达到该区间,而规模小、异质性高的公开 CYP3A4 数据集则失败。
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