scTHREAD单细胞长读长转录组数据库发布

scTHREAD 作者团队在 Nucleic Acids Research 发布开放获取的单细胞长读长转录组数据库 scTHREAD，用于整合、探索和检索单细胞长读长转录证据。该库收录 34 个人与小鼠数据集的 453 个 run，覆盖 923 389 个由 Oxford Nanopore 和 PacBio 测序的细胞。 作者团队称，其统一且平台感知的流程编目了 12 471 531 条 run–转录本观测，其中 30% 带有 210 341 个不同 Ensembl 转录本标识符之一；异构体与 poly(A) 位点使用、剪接连接支持和等位基因感知计数均与来源研究、run、细胞类型和单细胞保持关联，覆盖度允许时还预计算了差异使用。 记录可通过网页界面探索，并通过批量下载或文档化 API 检索。

AI 根据报道生成 · 1 小时前更新

还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。