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Evo 2 凭少量示例设计调控序列并在小鼠脑内验证

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AI 综述

Arc Institute 与斯坦福团队在 bioRxiv 预印本中报告,Evo 2 无需额外训练,仅凭提示中 4–64 个示例即可从头生成 5' UTR、IRES、启动子、增强子等 5 类调控元件,产率 30–50%,与已知序列相似度低于 60%。 作者用改造的 AlphaGenome 作奖励模型、Enformer 和 Borzoi 评估设计,并将 9 条设计装入 AAV 经眶后注射递送到小鼠脑内:7 条驱动可检测表达,6 条呈空间局限标记,其中 2 条以 73% 和 95% 特异性标记第 5 层端脑外神经元。Arc Institute 称,这些增强子原本针对人脑细胞类型设计,却在小鼠脑内同样起效,提示脑调控密码在进化上存在保守性。 除增强子外,其余几类元件的设计目前仅为计算预测,尚未经实验测试。

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10月29日
  1. Arc Institute精选
    Evo 2 用上下文学习仅凭数十个示例从头设计调控序列

    Arc Institute 与斯坦福团队在 bioRxiv 预印本中报告,Evo 2 具备上下文学习能力,无需额外训练,仅凭提示中 4-64 个示例即可从头生成 5 类调控元件(5' UTR、IRES、启动子、增强子等),产率 30-50%、序列相似度低于 60%。作者用改造的 AlphaGenome 作为奖励模型、Enformer 和 Borzoi 评估设计,将 9 条设计装入 AAV 经眶后注射递送到小鼠脑内,其中 7 条驱动可检测表达、6 条呈空间局限标记,2 条以 73% 和 95% 特异性标记第 5 层端脑外神经元。

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