PlasmidNL 质粒流行病学 R/Shiny 应用发布

PlasmidNL 作者团队发布交互式 R/Shiny 应用 PlasmidNL，用于比较质粒流行病学分析。该应用把预计算的质粒聚类结果与 PlasmidFinder、MOB-suite 分型输出、耐药基因谱和流行病学元数据整合到同一分析环境，支持在大型数据集上交互探索质粒种群结构、耐药决定因子分布及相关元数据。 作者称，其关键功能是让用户自有数据集与荷兰国家监测收藏进行背景比对；该收藏包含 2012 至 2022 年间从产碳青霉烯酶菌株收集的 4,596 个质粒。作者同时提供可复现的预处理流程，用于生成标准化输入文件。 PlasmidNL 以网页服务和本地部署两种方式免费提供，源代码以 MIT 许可在 GitHub 公开。

AI 根据报道生成 · 2 小时前更新

还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。