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转座子插入驱动谷子驯化表观变异

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AI 综述

一项发表于 Nature Communications 的研究以谷子为对象,分析 60 份野生与栽培材料的 DNA 甲基化组,鉴定出 76,815 个差异甲基化区域,并发现这些区域与广泛存在的转座子插入多态性相关。研究团队据此列出与种子落粒、分枝和生长习性相关的转座子清单。 功能分析显示,多效基因 SiGW3 的 5′ UTR 中两个 DNA/PIF-Harbinger 元件插入会调节该基因表达,并影响株型、穗形态和籽粒大小。作者据此认为,自然发生的转座子多态性产生可遗传的表观遗传变异,参与谷子驯化中的表型演化,并对作物改良具有参考意义。

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报道时间线

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11月7日
  1. Nature Communications
    转座子多态性驱动谷子驯化中的表观遗传变异与表型分化

    研究以谷子(Setaria italica)为对象,分析 60 份野生与栽培材料的 DNA 甲基化组,发现转座子插入多态性与广泛的表观遗传变异相关,共鉴定出 76,815 个差异甲基化区域。作者据此构建了与种子落粒、分枝和生长习性相关的转座子清单。功能分析显示,多效基因 SiGW3 的 5′ UTR 中两个 DNA/PIF-Harbinger 元件插入会调节该基因表达,并影响株型、穗形态和籽粒大小。作者认为,自然发生的转座子多态性产生可遗传的表观遗传变异,参与作物驯化过程中的表型演化,对作物改良具有参考意义。

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