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KEGG扩展基因组与通路表征能力

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AI 综述

KEGG数据库在《Nucleic Acids Research》发表论文，介绍其以KO（KEGG Orthology）为节点、把特定生物中的实验证据推广到其他生物的基因组到通路映射方法，并称该方法可适用于任何生物。随着KO数量增加和注释率提升，KEGG mapping的适用范围进一步扩大。现在，基因组中的KO集合与代谢通路中的module集合被用于刻画生物圈中的多种对象，包括生物、生物类群、微生物组、病毒及其组合，如内共生体—宿主、微生物组—宿主和病毒—宿主关系。论文同时称，由此得到的相似性树状图可能反映细胞功能、更具体地说是代谢功能的相似性，并可与系统发育树比较。

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最新进展10月27日 11:46

KEGG 数据库扩展用于刻画生物圈基因组与通路

报道时间线

沿着报道，了解事件的不同侧面。

10月27日

11:46
Nucleic Acids Research
KEGG 数据库扩展用于刻画生物圈基因组与通路
KEGG 数据库以分子连线图形式组织细胞与生物体层面功能知识，其 KO（KEGG Orthology）数据集把特定生物中的实验证据推广到其他生物，通路图与 module 等分子网络以 KO 为节点，因此从基因组到通路的 KEGG mapping 可适用于任何生物。随着 KO 数量增加和 KO 注释率提升，KEGG mapping 的适用范围进一步扩大。现在基因组中的 KO 集合与代谢通路中的 module 集合被用于刻画生物圈中的多种数据对象，包括生物、生物类群、微生物组、病毒及其组合，如内共生体—宿主、微生物组—宿主和病毒—宿主关系。

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