拟杆菌DGR驱动肠道菌蛋白多样化
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拟杆菌DGR驱动肠道菌蛋白多样化
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AI 综述
加州大学洛杉矶分校 Jeff F. Miller 团队在 Science 发表研究,在 618 株人源拟杆菌分离株中鉴定出 1113 个多样性生成逆转录元件(DGR),分属 29 个物种;这些元件的可变蛋白可归为 35 个簇、三大功能类别,包括 V 型菌毛黏附蛋白、胞质激酶和病毒受体结合蛋白。 研究称,DGR 可随整合接合元件在菌株与物种间水平转移,结肠黏液层中元件切离活性提升近 700 倍。Bov 与 Bfi 的 DGR 在体外和单一定植小鼠中组成型高活性,而 Bfr、Bth、Bun 的活性低 100 至 10000 倍,受转录水平调控。 上述体内活性测定使用单一拟杆菌菌株定植无菌 Swiss Webster 小鼠;母婴配对与成人肠道宏基因组分析则基于短读长测序数据,测序深度往往不足以完整捕捉可变序列的变异与熵值。
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最新进展10月30日 17:33
Science:DGR介导拟杆菌肠道微生物组靶向蛋白进化报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月30日
- 公众号:宏基因组Science:DGR介导拟杆菌肠道微生物组靶向蛋白进化
加州大学洛杉矶分校Jeff F. Miller团队在Science发表研究,在618株人源拟杆菌分离株中鉴定出1113个多样性生成逆转录元件(DGR),分属29个物种,其可变蛋白可归为35个簇、三大功能类别,包括V型菌毛黏附蛋白、胞质激酶和病毒受体结合蛋白。研究发现DGR可随整合接合元件在菌株与物种间水平转移,结肠黏液层中元件切离活性提升近700倍。Bov与Bfi的DGR在体外和单一定植小鼠中组成型高活性,而Bfr、Bth、Bun的活性低100至10000倍,受转录水平调控。
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