拉曼条形码区分20种SARS-CoV-2变异株RNA结构
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拉曼条形码区分20种SARS-CoV-2变异株RNA结构
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日本关西医科大学 Giuseppe Pezzotti 团队用拉曼光谱读取 SARS-CoV-2 病毒 RNA 的二级结构,将光谱特征编码为“拉曼条形码”,成功区分了 20 株变异株与亚型。研究从原始日本分离株、alpha、beta、gamma、delta、lambda、theta、mu 及 12 种 omicron 亚型中提取 RNA 链,系统采集光谱并做数学解卷积;这些毒株碱基组成高度相似,但光谱信号差异明显且可重复,常规主成分分析只能有限分离,条形码方法则全部分开。差异被关联到主链构象、发夹结构、茎长和碱基配对环境等二级结构特征。 研究于 2026 年 9 月 30 日在线发表于《Advanced Science》。团队称,拉曼分析无需完整 RNA 测序即可表征病毒 RNA,未来或可在疫情暴发、急诊或重症监护等需要及时信息的场景中用于快速筛查新变异株;这一用途目前仍是潜在方向。
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最新进展10月21日 01:40
拉曼光谱条形码可依据 RNA 结构区分 20 种 SARS-CoV-2 变异株报道时间线
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10月21日
- Phys.org拉曼光谱条形码可依据 RNA 结构区分 20 种 SARS-CoV-2 变异株
日本关西医科大学 Giuseppe Pezzotti 团队用拉曼光谱读取病毒 RNA 的二级结构,将光谱特征编码为“拉曼条形码”,成功区分了 20 株 SARS-CoV-2 变异株与亚型。研究从原始日本分离株、alpha、beta、gamma、delta、lambda、theta、mu 及 12 种 omicron 亚型中提取 RNA 链,系统采集拉曼光谱并做数学解卷积;这些毒株的碱基组成高度相似,但光谱信号差异明显且可重复,常规主成分分析只能有限分离,条形码方法则全部分开。差异被关联到主链构象、发夹结构、茎长和碱基配对环境等二级结构特征。
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