拉曼光谱条形码可依据 RNA 结构区分 20 种 SARS-CoV-2 变异株

日本关西医科大学 Giuseppe Pezzotti 团队用拉曼光谱读取病毒 RNA 的二级结构，将光谱特征编码为“拉曼条形码”，成功区分了 20 株 SARS-CoV-2 变异株与亚型。研究从原始日本分离株、alpha、beta、gamma、delta、lambda、theta、mu 及 12 种 omicron 亚型中提取 RNA 链，系统采集拉曼光谱并做数学解卷积；这些毒株的碱基组成高度相似，但光谱信号差异明显且可重复，常规主成分分析只能有限分离，条形码方法则全部分开。差异被关联到主链构象、发夹结构、茎长和碱基配对环境等二级结构特征。