TCRi框架从单细胞RNA与TCR数据推断T细胞动态

论文作者提出 TCRi，一个分层贝叶斯信息论框架，用于从配对的单细胞转录组与 TCR 测序数据推断遗传克隆型与转录表型之间的联合概率分布。该方法把表型归属当作概率推断：用变分自编码器将单细胞表达嵌入结构化隐空间，再由分层贝叶斯模型在克隆型、患者和协变量之间共享信息，学习克隆型特异的表型分布，并计算克隆型熵、表型熵、表型通量及克隆型与表型间互信息等信息论量。 作者称，在 4 个真实数据集共 167,118 个来自接受抗 PD-(L)1 免疫检查点阻断治疗的癌症患者的 CD8 T 细胞上应用 TCRi，互信息能稳健区分治疗应答。

AI 根据报道生成 · 43 分钟前更新

还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。