anndataR 让 R 原生读写 h5ad 并互转单细胞对象
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anndataR 让 R 原生读写 h5ad 并互转单细胞对象
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AI 综述
生信菜鸟团介绍 scverse 出品的 anndataR 包，可在 R 中原生读取 h5ad，并与 Seurat、SingleCellExperiment 对象互转。作者称，该包基于 rhdf5 直接读写 h5ad，不需要 Python 或 conda，这是它相对 zellkonverter、sceasy 的主要优势。 作者指出，此前常用的 sceasy 基于 Seurat V4，对 scanpy 和 Seurat 版本依赖重，还需配置完整的 Python 与 R 环境。上述对比与优势均为作者说法。
AI 根据报道生成 · 48 分钟前更新
最新进展11月7日 12:00
用 anndataR 在 R 中原生读取和转换 h5ad报道时间线
沿着报道，了解事件的不同侧面。
11月7日
- 公众号：生信菜鸟团精选用 anndataR 在 R 中原生读取和转换 h5ad
生信菜鸟团介绍了 scverse 出品的 anndataR 包，用于在 R 中原生读取 h5ad 并与 Seurat、SingleCellExperiment 对象互转。作者指出，此前常用的 sceasy 基于 Seurat V4、对 scanpy 和 Seurat 版本依赖重，还需完善的 Python 与 R 环境；anndataR 则基于 rhdf5 直接读写 h5ad，不需要 Python 或 conda，这是它相对 zellkonverter、sceasy 的主要优势。
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