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朱波峰团队开发东亚祖源推断体系

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AI 综述

南方医科大学、山西医科大学朱波峰团队联合南方医科大学刘超院士团队、军事医学研究院周喆研究员团队,在 Cell Reports 发表研究,开发出 6 色荧光多重扩增体系 EastFocusAISNPplex 61,用于洲际与东亚人群精细祖源推断。 研究用可解释 AI(SHAP 结合递归特征消除)从 1,874 个候选位点中筛出 58 个核心 AIM-SNPs,并整合性别位点及 Y-InDels,扩增片段均在 70~200 bp,检出限 250~500 pg。团队称该系统抗抑制力强、兼容基层实验室常规毛细管电泳平台,适配微量、降解及接触性生物检材。 在测试集中,大洲模型 AUC 为 0.981~0.999,东亚模型 AUC 均大于 0.940。

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10月30日
  1. 公众号:BioArtMED
    Cell Rep | 朱波峰团队等开发 EastFocusAISNPplex 61 体系:可解释 AI 驱动标记甄选与东亚人群精细祖源推断

    南方医科大学、山西医科大学朱波峰团队联合南方医科大学刘超院士团队、军事医学研究院周喆研究员团队,在 Cell Reports 发表研究,将可解释 AI 与等位基因特异性 PCR(AS-PCR)结合,开发出 6 色荧光多重扩增体系 EastFocusAISNPplex 61,用于洲际与东亚人群精细生物地理祖源推断。研究用 SHAP 结合递归特征消除的层次化框架,从 1,874 个候选位点中筛出 58 个核心 AIM-SNPs,并整合性别位点及 Y-InDels,扩增片段均在 70~200 bp,检出限 250~500 pg。

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