多组学图谱刻画人原代B细胞激活响应
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多组学图谱刻画人原代B细胞激活响应
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AI 综述
研究团队在《Nature Communications》发表原代人B细胞激活的多组学图谱:取27名女性健康供者的外周血B细胞,在体外用激活BCR、TLR7、TLR9、CD40及诱导分化为DN2 B细胞等刺激,并在多个时间点用RNA-seq、CITE-seq和ATAC-seq刻画响应。 分析识别出依赖激活状态的B细胞状态、刺激特异的转录因子和调控区域、免疫介导疾病相关基因表达的动态变化,以及与免疫介导疾病遗传风险相关的特定开放染色质区域。分析数据可通过交互式浏览器访问。
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最新进展10月23日 08:00
多组学刻画人原代 B 细胞在多种刺激下的激活响应报道时间线
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10月23日
- Nature Communications多组学刻画人原代 B 细胞在多种刺激下的激活响应
研究对 27 名女性健康供者的外周血 B 细胞进行体外刺激,用 RNA-seq、结合表面蛋白标记的单细胞 RNA-seq(CITE-seq)和 ATAC-seq 在多个时间点刻画激活响应。刺激包括激活 B 细胞受体(BCR)、TLR7、TLR9、CD40,以及诱导分化为 DN2(IgD^–CD27^–CD11c^+CD21^–)B 细胞。分析揭示了依赖激活状态的 B 细胞状态、刺激特异的转录因子和调控区域、免疫介导疾病相关基因表达的动态变化,以及与免疫介导疾病遗传风险相关的特定开放染色质区域。
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