GSE103479 性别信号缺失引质疑
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GSE103479 性别信号缺失引质疑
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AI 综述
生信技能树用性染色体基因分析 GSE103479 结直肠癌芯片数据,发现男性 Y 染色体信号基本消失,sex_score 全在负值区且连续无断层,GMM 的 BIC 差为 0,数据中不存在“男性”这一群,因此质疑该数据集性别注释,并称其疑似饶毅在“饶议科学”提到的逆向编造组学数据。 该数据集为 2018 年一项结直肠癌预后研究的 156 个 II/III 期原发结肠肿瘤样本,使用 Almac Diagnostics Custom Xcel array(GPL23985)定制芯片,作者标注了 gender:ch1。 生信技能树同时指出,GSE103479 是 bulk 原发肿瘤,男性肿瘤中 Y 染色体丢失(LOY)可能发生,加上肿瘤 RNA 被间质/免疫细胞稀释,胚系性别信号可能被抹平,使男性肿瘤在表达上“变成”女性样;这一解释与“编造数据”的质疑并存。
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最新进展11月7日 08:24
饶毅所说的编造测序数据:GSE103479 结直肠癌芯片性别信号缺失报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
11月7日
- 公众号:生信技能树饶毅所说的编造测序数据:GSE103479 结直肠癌芯片性别信号缺失
生信技能树以 GSE103479 为例,演示该结直肠癌表达量芯片数据中男性 Y 染色体信号基本消失,疑似饶毅此前在“饶议科学”提到的逆向编造组学数据。该数据集含 156 个 II/III 期原发结肠肿瘤样本,使用 Almac Diagnostics Custom Xcel array(GPL23985),作者标注了 gender:ch1。
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