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Deliverome 发布人类表面蛋白可及图谱

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AI 综述

Hertz 研究员 Becca Carlson 与 Deliverome 项目团队用 AI 分析已发表研究,构建了人类细胞表面蛋白的开放交互图谱,标出 1108 个未被 UniProt、GO CC、Human Protein Atlas、Cell Surface Protein Atlas 和 SURFY 五个常用数据库收录的候选表面蛋白。团队称,这五个数据库仅对 188 个表面蛋白有一致认定。 相关论文《The accessible human surfaceome》已发布在 bioRxiv,由团队与 Coral Biosciences 的 Michael Smallegan 合著。团队称,AI 系统在一个由 147 个蛋白手工标注、现有数据库常有分歧的测试集 SurfaceBench 上正确分类了 95.7%。 与论文一同发布的还有免费交互资源 Open View,供科学家查看表面蛋白及每项分类所依据的研究;公开 API 和开源代码可供研究者将结果用于自身研究和药物发现流程。

AI 根据报道生成 · 2 小时前更新

报道时间线

沿着报道,了解事件的不同侧面。

10月30日
  1. Phys.org
    Deliverome 项目用 AI 构建人类表面蛋白图谱,标出五大数据库遗漏的 1108 个候选靶点

    Hertz 研究员 Becca Carlson 与 Deliverome 项目团队用 AI 分析已发表研究,构建了人类细胞表面蛋白(surfaceome)的开放交互图谱,标出 1108 个未被 UniProt、GO CC、Human Protein Atlas、Cell Surface Protein Atlas 和 SURFY 这五个常用数据库收录的候选表面蛋白。

10月21日
  1. Sophien Kamoun
    Deliverome 发布人类表面蛋白可及图谱

    Sophien Kamoun 分享了 Deliverome 发布的开放图谱,该工作指出五大人类表面蛋白数据库仅对 188 个蛋白达成一致,因此团队改用 Claude 阅读文献,并将结论逐条追溯到原文引文。

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