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Sequence Display生成SlugCas9序列-活性数据集

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AI 综述

研究团队用 Sequence Display 方法，针对 Staphylococcus lugdunensis Cas9（SlugCas9）在 NNAN 家族 PAM（含 NNAA、NNAT、NNAC、NNAG）上生成多重、大规模序列-活性数据集，定量解析单点与组合突变在不同 PAM 背景下如何改变核酸酶活性。 将这批数据与蛋白语言模型结合后，作者构建了细粒度活性图谱，并筛选出在 NNAN PAM 上活性增强且范围拓宽的 SlugCas9 变体。作者称，这些变体在培养的哺乳动物细胞中改善了部分受 NNAN 限制的内源位点的碱基编辑，包括 APOC3 和 PCSK9 中与疾病相关的位点。

AI 根据报道生成 · 2 小时前更新

最新进展10月30日 08:00
Sequence Display 生成大规模序列-活性数据，将 SlugCas9 改造至难及 PAM

报道时间线

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10月30日
  1. Nature Communications
    Sequence Display 生成大规模序列-活性数据，将 SlugCas9 改造至难及 PAM

    研究团队用 Sequence Display 方法，针对 Staphylococcus lugdunensis Cas9（SlugCas9）在 NNAN 家族 PAM（含 NNAA、NNAT、NNAC、NNAG）上生成多重、大规模的序列-活性数据集，定量解析单点与组合突变如何在不同 PAM 背景下改变核酸酶活性。将这批数据与蛋白语言模型结合后，作者构建了细粒度活性图谱，并筛选出在 NNAN PAM 上活性增强且范围拓宽的 SlugCas9 变体。

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