RIFTT融合基因检测流程发布
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RIFTT融合基因检测流程发布
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AI 综述
RIFTT作者团队发布融合基因检测流程RIFTT,将Arriba与FusionCatcher两个融合基因检测工具整合,并引入Promiscuity Score、Fusion Transcript Score和Robustness Score三个新评分指标。 作者称,在TCGA-LAML、BeatAML和LL-100数据集上的基准测试显示,与单一检测工具相比,RIFTT可将候选融合基因数量最多减少95%。该流程封装于Singularity容器,提供标准化可视化与带注释表格输出,作者称其可支持科研流程和临床分子诊断的下游分析。 RIFTT在GitHub(https://github.com/pkerbs/RIFTT)免费提供。上述减少候选数量的效果为作者在特定数据集上的测试结果。
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最新进展10月30日 08:00
RIFTT 发布:整合 Arriba 与 FusionCatcher 的肿瘤转录组融合基因检测流程报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月30日
- BMC BioinformaticsRIFTT 发布:整合 Arriba 与 FusionCatcher 的肿瘤转录组融合基因检测流程
RIFTT 是一个用于在肿瘤转录组中稳健识别融合基因的分析流程,它整合了 Arriba 和 FusionCatcher 两个融合基因检测工具,并引入 Promiscuity Score、Fusion Transcript Score 和 Robustness Score 三个新评分指标。
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