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scSpatial单细胞空间组学图谱发布

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AI 综述

scSpatial 开发团队在 Nucleic Acids Research 发布单细胞空间组学图谱 scSpatial,整合 630 个项目、16 种空间技术产生的 1800 多张组织切片,并将超过 2000 万个具空间位置信息的细胞注释为 173 个标准化 Cell Ontology 类型。作者称,此类数据此前分散于各自论文、缺少综合资源,因此构建了这一带专家注释和高分辨率空间映射的图谱。 平台提供空间基因表达图谱、细胞类型分布图、空间可变基因、基因表达相关性和通路水平空间活性谱等分析与交互可视化功能。当前版本无需登录即可在 https://idrblab.org/scspatial/ 免费访问。

AI 根据报道生成 · 1 小时前更新

报道时间线

沿着报道,了解事件的不同侧面。

10月23日
  1. Nucleic Acids Research精选
    scSpatial 发布单细胞空间组学图谱,整合 630 个项目逾 1800 张组织切片

    scSpatial 作为单细胞空间组学(SCSO)图谱发布,整合了 630 个项目、16 种空间技术产生的 1800 多张组织切片,并把超过 2000 万个具空间位置信息的细胞注释为 173 个标准化 Cell Ontology 类型。作者指出,SCSO 数据此前分散在各自发表的论文中,缺少综合资源,因此构建了这一带专家注释和高分辨率空间映射的图谱。平台提供面向 SCSO 的分析与交互可视化,包括空间基因表达图谱、细胞类型分布图、空间可变基因、基因表达相关性和通路水平的空间活性谱。scSpatial 无需登录即可免费访问。

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