H&E切片空间特征可解释基因表达变异
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H&E切片空间特征可解释基因表达变异
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AI 综述
一项发表于 BMC Bioinformatics 的研究称,从常规 H&E 全切片图像提取的细胞类型特异性空间特征,能在细胞类型组成之外解释基因表达变异。 研究使用 471 例正常前列腺组织样本的 bulk RNA 表达数据与配对全切片图像,经细胞核分割和细胞类型分类,提取 7 类细胞类型比例和 38 个反映局部邻域与组织结构的空间特征。研究据此认为,这些可解释的空间特征捕捉到了细胞类型组成未反映的、与转录相关的组织结构。 该结论来自正常前列腺组织样本,是否适用于其他组织或疾病场景尚未在报道中说明。
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最新进展10月28日 08:00
从数字化 H&E 切片提取细胞类型特异性可解释空间特征,解释细胞类型组成之外的基因表达变异报道时间线
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10月28日
- BMC Bioinformatics从数字化 H&E 切片提取细胞类型特异性可解释空间特征,解释细胞类型组成之外的基因表达变异
从常规 H&E 全切片图像提取的细胞类型特异性空间特征,可在细胞类型组成之外解释基因表达变异。研究使用 471 例正常前列腺组织样本的 bulk RNA 表达数据与配对全切片图像,经细胞核分割和细胞类型分类提取 7 类细胞类型比例与 38 个反映局部邻域和组织结构的空间特征。
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