PathLUPI:训练用转录组,推理仅凭病理图像预测分子特征
热点事件持续更新
PathLUPI:训练用转录组,推理仅凭病理图像预测分子特征
1 篇报道1 个报道来源20 小时前更新
先了解这件事
AI 综述
研究团队提出 PathLUPI 方法:训练阶段引入转录组作为特权信息,提取基因组锚定的组织学嵌入,使推理时仅凭全切片图像(WSI)即可预测分子特征。团队在 20 个队列、11361 例样本的 49 个分子肿瘤任务上评估,称其性能优于仅用 WSI 训练的传统方法。 作者报告,在 18 个生物标志物预测与分子分型任务上 AUROC 至少 0.80,在覆盖 5 类主要癌症的生存队列中一致性指数至少 0.70;PathLUPI 嵌入还显示出与特定基因型相关的细胞形态特征,并在代表性高分辨率空间转录组样本中验证了空间一致性。作者认为,该策略可将分子信息接入常规病理流程。上述性能与一致性均为研究团队的评估结论。
AI 根据报道生成 · 2 小时前更新
最新进展11月2日 08:00
PathLUPI 用基因组锚定的组织学嵌入提升病理图像分子预测报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
11月2日
- Nature Communications精选PathLUPI 用基因组锚定的组织学嵌入提升病理图像分子预测
研究团队提出 PathLUPI,在训练阶段引入转录组作为特权信息,提取基因组锚定的组织学嵌入,使推理时仅凭全切片图像(WSI)即可预测分子特征。作者在 20 个队列、11361 例样本的 49 个分子肿瘤任务上评估,称其性能优于仅用 WSI 训练的传统方法:在 18 个生物标志物预测与分子分型任务上 AUROC 至少 0.80,在覆盖 5 类主要癌症的生存队列中一致性指数至少 0.70。PathLUPI 嵌入还显示出与特定基因型相关的细胞形态特征,并在代表性高分辨率空间转录组样本中验证了其空间一致性。作者认为,该策略可将分子信息接入常规病理流程。
本事件热度走势
还没有足够的连续观测数据,暂不绘制趋势。