Nature Communications·· 20 小时前精选AI 评分72
PathLUPI 用基因组锚定的组织学嵌入提升病理图像分子预测
Genome-anchored foundation model embeddings improve molecular prediction from histology images
AI 导读
研究团队提出 PathLUPI，在训练阶段引入转录组作为特权信息，提取基因组锚定的组织学嵌入，使推理时仅凭全切片图像（WSI）即可预测分子特征。作者在 20 个队列、11361 例样本的 49 个分子肿瘤任务上评估，称其性能优于仅用 WSI 训练的传统方法：在 18 个生物标志物预测与分子分型任务上 AUROC 至少 0.80，在覆盖 5 类主要癌症的生存队列中一致性指数至少 0.70。PathLUPI 嵌入还显示出与特定基因型相关的细胞形态特征，并在代表性高分辨率空间转录组样本中验证了其空间一致性。作者认为，该策略可将分子信息接入常规病理流程。
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来源：Nature Communications · doi.org
推荐理由
在 49 个分子肿瘤任务、11361 例样本上验证，训练时用转录组作为特权信息，推理时只用 WSI，为病理图像分子预测提供可迁移思路。