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ECOD 发布重建网页与2027版分类

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AI 综述

进化分类数据库 ECOD 发布 2027 版,完成网页资源整体重建并更新蛋白结构域分类。ECOD 称目前共分类 290 万个结构域,其中约 137 万个来自 PDB 实验结构,151 万个来自 AlphaFold 预测模型。 检索改为序列、结构、关键词三种方式,Foldseek 成为网页端主要检索方法,检索对象为约 45.7 万个代表性结构域数据库,该库也对外分发供本地使用;结果通过 Mol* 交互查看器展示,并新增 API 供程序化访问。ECOD 称其可通过 http://prodata.swmed.edu/ecod 免费访问。

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11月4日
  1. Nucleic Acids Research精选
    ECOD 2027 版重建网页界面并更新蛋白结构域分类

    进化分类数据库 ECOD 发布 2027 版,完成网页资源整体重建,并更新蛋白结构域分类。ECOD 目前收录 290 万个结构域,其中约 137 万个来自 PDB 实验结构,151 万个来自 AlphaFold 蛋白结构数据库的预测模型。检索改为序列、结构、关键词三种方式,Foldseek 成为网页端主要检索方法,检索对象为约 45.7 万个代表性结构域数据库,该库也对外分发供本地使用;结果通过 Mol* 交互查看器展示,并新增 API 供程序化访问。

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