自制高密度空间转录组系统实现异构体空间解析

研究团队在 Nature Communications 报告了一套实验室自制的高密度空间转录组系统：用三段组合条形码扩大条形码容量，把长读段分配到空间位置；同一张捕获芯片上生成的全长 cDNA 被拆分，在同一空间坐标系内同时做高深度短读定量和单分子长读段分析。 在不相容的番茄—辣椒嫁接材料和小鼠胚胎中，该方法识别出具有空间定位的未注释异构体和内含子保留事件，并显示仅凭基因水平表达看不到的异构体使用区域差异。作者称，该体系为在同一组织中结合空间基因表达定量与全长转录结构分析提供了框架。

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还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。