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AGEMdb发布按祖源分层的基因表达插补模型库

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AI 综述

研究团队在 BMC Bioinformatics 发布 AGEMdb 数据库,提供按祖源分层的跨组织基因表达插补模型,用户可按组织、基因等条件在线浏览、检索和下载。 团队用 GTEx 的基因型与表达数据,经质量控制和混杂因素校正后,整理出 689 名欧洲裔和 111 名非洲裔美国人个体,并以 UTMOST 框架分别构建祖源特异模型。 作者称,现有公开 TWAS 模型多基于欧洲裔人群,这种欧洲祖源偏倚限制了模型跨人群迁移与泛化,纳入非洲裔美国人特异模型有助于缓解该偏倚、支持更公平的基因-性状关联分析。

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报道时间线

沿着报道,了解事件的不同侧面。

11月6日
  1. BMC Bioinformatics
    AGEMdb 数据库发布祖源特异性跨组织基因表达插补模型

    AGEMdb 是一个可在线浏览、检索和下载祖源特异性跨组织基因表达插补模型的数据库。研究团队利用 GTEx 的基因型与基因表达数据,经质量控制和混杂因素校正后,整理出 689 名欧洲裔个体和 111 名非洲裔美国人个体的数据集,并用 UTMOST 框架分别构建祖源特异的跨组织表达插补模型。用户可按组织和基因等条件筛选并下载模型。作者指出,现有公开 TWAS 模型多基于欧洲裔人群,这种欧洲祖源偏倚限制了模型在不同人群间的迁移与泛化,而纳入非洲裔美国人特异模型有助于缓解这一偏倚,支持更公平的基因-性状关联分析。

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