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研究揭示Mpro抑制剂对二聚化的相反调控

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AI 综述

一项发表于 eLife 的研究显示,SARS-CoV-2 主蛋白酶 Mpro 的两类抑制剂对二聚化的作用方向相反。研究团队用 13C 标记结合原生质谱和氢氘交换质谱,考察 Mpro 单体-二聚体平衡及抑制剂结合后的构象变化。 PF-07321332、PF-00835231、GC376、boceprevir 等肽模拟抑制剂显著把平衡推向二聚体,抑制亚基交换并刚性化二聚界面;ebselen 则妨碍二聚体形成、增加界面柔性。 串联质谱还发现 ebselen 在 C300 的新共价结合位点;分子动力学模拟与突变分析表明,该修饰通过变构改变二聚界面氢键网络,参与 ebselen 破坏二聚体与抑制酶活。

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报道时间线

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10月26日
  1. eLife
    研究揭示肽模拟抑制剂促进、ebselen 破坏 SARS-CoV-2 M pro 二聚化的不同机制

    研究以 13C 标记结合原生质谱和氢氘交换质谱(HDX-MS),考察 SARS-CoV-2 主蛋白酶 M pro 的单体-二聚体平衡及抑制剂结合引起的构象变化。结果显示两类抑制剂机制相反:PF-07321332、PF-00835231、GC376、boceprevir 等肽模拟抑制剂显著把平衡推向二聚体,抑制亚基交换并刚性化二聚界面;ebselen 则妨碍二聚体形成、增加界面柔性。串联质谱还发现 ebselen 在 C300 的新共价结合位点,分子动力学模拟与突变分析表明该修饰通过变构改变二聚界面氢键网络,直接参与 ebselen 破坏二聚体与抑制酶活。

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