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宏基因组荟萃分析将IBD菌群失调与炎症关联

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AI 综述

一项发表于 Nature Communications 的宏基因组荟萃分析对 4,839 份公共样本进行高分辨率分析,结论是:炎症性肠病(IBD)相关菌群失调主要表现为共生菌相对耗竭,而非致病类群扩张,同时个体内与个体间的微生物组变异性升高。 研究区分了 IBD 亚型、炎症、时间与个体差异的影响:30% 的物种与 IBD 相关,但其中仅 73% 的关联在所有时间点保持一致;IBD 相关细菌在宿主内持续存在能力下降,菌株丢失增加、定植减少,另有 8% 的共生菌种存在独立于物种层面变化的菌株水平关联。 作者构建炎症指数,称炎症可解释微生物组成与丰度的大部分变异,并提出炎症与共生菌丢失相关并可能促使其丢失,从而限制微生物组的恢复与韧性。

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10月21日
  1. Nature Communications精选
    时间分辨宏基因组分析将 IBD 菌群失调与胃肠道炎症关联

    一项对 4,839 份公共宏基因组的高分辨率荟萃分析显示,炎症性肠病(IBD)相关菌群失调主要表现为共生菌相对耗竭,而非致病类群扩张,同时个体内与个体间的微生物组变异性升高。研究区分了 IBD 亚型、炎症、时间与个体差异的影响,发现 30% 的物种与 IBD 相关,但其中仅 73% 的关联在所有时间点保持一致。IBD 相关细菌在宿主内持续存在能力下降,菌株丢失增加、菌株定植减少;另有 8% 的共生菌种存在独立于物种层面变化的菌株水平关联。作者构建炎症指数,表明炎症可解释微生物组成与丰度的大部分变异,并提出炎症与共生菌丢失相关并可能促使其丢失,从而限制微生物组的恢复与韧性。

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