时间分辨宏基因组分析将 IBD 菌群失调与胃肠道炎症关联

一项对 4,839 份公共宏基因组的高分辨率荟萃分析显示，炎症性肠病（IBD）相关菌群失调主要表现为共生菌相对耗竭，而非致病类群扩张，同时个体内与个体间的微生物组变异性升高。研究区分了 IBD 亚型、炎症、时间与个体差异的影响，发现 30% 的物种与 IBD 相关，但其中仅 73% 的关联在所有时间点保持一致。IBD 相关细菌在宿主内持续存在能力下降，菌株丢失增加、菌株定植减少；另有 8% 的共生菌种存在独立于物种层面变化的菌株水平关联。作者构建炎症指数，表明炎症可解释微生物组成与丰度的大部分变异，并提出炎症与共生菌丢失相关并可能促使其丢失，从而限制微生物组的恢复与韧性。