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基因型分类器预测肺炎克雷伯菌环丙沙星耐药

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AI 综述

KlebNET-GSP AMR 基因型-表型研究组基于 2001 至 2021 年间 27 个国家 12,167 株肺炎克雷伯菌复合群分离株的配对数据,开发了一个规则分类器:按 gyrA 和 parC 喹诺酮耐药决定区突变数量及质粒介导喹诺酮耐药基因(含 aac(6')-Ib-cr)数量预测环丙沙星耐药,并用外部贡献的 7,030 株分离株数据验证。 研究组将该分类器实现在命令行工具 Kleborate 中,并集成到 Pathogenwatch 网络平台。研究组同时指出,仍有无法解释的耐药,且准确率不足以用于临床应用。

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报道时间线

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10月27日
  1. Genome Medicine精选
    肺炎克雷伯菌环丙沙星耐药可由基因型预测并揭示全球分布

    KlebNET-GSP AMR 基因型-表型研究组基于 2001 至 2021 年间 27 个国家 n = 12,167 株肺炎克雷伯菌复合群(Kp SC)分离株的配对数据,开发了一个规则分类器,按 gyrA 和 parC 喹诺酮耐药决定区突变数量及质粒介导喹诺酮耐药基因(含 aac(6')-Ib-cr)数量预测环丙沙星耐药。

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