PELICAN噬菌体基因组注释工具发布
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PELICAN噬菌体基因组注释工具发布
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AI 综述
PELICAN 作者团队发布命令行噬菌体基因组注释工具 PELICAN,流程为整合多工具预测、对非共识基因做概率与机器学习评估、消解重叠预测,并对重叠位置做密码子偏好性检查后输出最终注释。 作者以经转录组学验证的参考噬菌体基因组注释做验证,并与其他同类工具比较:PELICAN 召回率最高,但假阳性率高于部分工具,F1 值具竞争力。作者称,其证据主要基于预测编码区所编码假定蛋白的蛋白折叠打分,提示这些假阳性多数可能实为真阳性。
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最新进展10月22日 08:00
PELICAN:一款新的噬菌体基因组注释工具报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月22日
- BMC BioinformaticsPELICAN:一款新的噬菌体基因组注释工具
PELICAN 是一款命令行噬菌体基因组注释工具,流程分为四步:整合多工具预测、对非共识基因做概率与机器学习评估、消解重叠预测、对重叠位置做密码子偏好性检查以输出最终注释。验证采用经转录组学验证的参考噬菌体基因组注释,并与其他噬菌体基因组注释工具比较,PELICAN 召回率最高,但假阳性率高于部分工具;作者提供的证据主要基于预测编码区所编码假定蛋白的蛋白折叠打分,提示这些假阳性多数可能实为真阳性。与现有同类工具相比,PELICAN 在基因召回率上更优,F1 值具有竞争力。
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