GEMRA方法校正GWAS用药状态偏倚
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GEMRA方法校正GWAS用药状态偏倚
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AI 综述
Amanda H. W. Chong等提出遗传经验用药缩减校正(GEMRA)方法,对报告用药参与者的表型值做启发式经验校正,以减少用药状态对全基因组关联分析遗传效应估计的偏倚。模拟结果显示,GEMRA 的直接遗传效应估计偏倚更小、统计功效高于将用药作为协变量、仅保留未用药样本或不作校正等常见策略。 作者用英国生物样本库与乌干达基因组资源的多人群数据,分别估计他汀类药物对 LDL 胆固醇、降压药对收缩压和舒张压的校正。结果显示相对而非绝对校正更能刻画用药效应,LDL 胆固醇、收缩压和舒张压的降幅分别约为 40%、10% 和 10%,且在不同人群中表现一致;若效应尺度设定错误,会产生虚假的跨人群用药效应差异。
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最新进展11月2日 22:00
GEMRA:在全基因组关联分析中校正用药状态的新方法报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
11月2日
- PLOS GeneticsGEMRA:在全基因组关联分析中校正用药状态的新方法
研究提出遗传经验用药缩减校正(GEMRA)方法,通过对报告用药参与者的表型值做启发式经验校正,减少用药状态对全基因组关联分析遗传效应估计的偏倚。模拟结果显示,GEMRA 的直接遗传效应估计偏倚更小、统计功效高于将用药作为协变量、仅保留未用药样本或不作校正等常见策略。作者用英国生物样本库与乌干达基因组资源的多人群数据,分别估计他汀类药物对 LDL 胆固醇、降压药对收缩压和舒张压的校正。结果显示相对而非绝对校正更能刻画用药效应,LDL 胆固醇、收缩压和舒张压的降幅分别约为 40%、10% 和 10%,且在不同人群中表现一致;若效应尺度设定错误,会产生虚假的跨人群用药效应差异。
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